С точки зрения коллекции растений и площади самый богатый отдел Восточной Азии.

40% коллекции живых растений сада приходится именно на этот отдел. Это объясняется и тем, что климатические условия влажных субтропиков Восточной Азии, и особенно, Японии, аналогичны нашим климатическим условиям.

Отдел расположен на возвышенности террассовой россыпью и занимает 6,05 гектаров площади. Большую часть представляет восточная экспозиция, меньшую – северная и западная. Она граничит с Гималайским, Мексиканским и Североамериканским отделами. Отдел существует со дня основания сада.

В 1913 году при содействии батумской сельскохозяйственной общественности, сад установил связи с известными японскими фирмами: «Нерзери компании» и «Сеитаро Араи», которые передали саду 314 видов японских растений.

В отделе большинством представлены реликты тропической флоры третичного периода: Ginkgo biloba, Metasequoia glyptostroboides, тропический вид саду придает многолетняя трава – японский банан, большелистная бумажная фация, пуэрария, актинидия и другие. В богатом ассортименте представлены индийская ель, камелия, магнолия, сосна, падуб, королопсис, линдера, можжевельник, различные виды понтийского родендрона, барбарис, японская декоративная вишня, хурма, клен, энкиантус, криптомерия, аукуба, которая всю зиму сохраняет плоды алого красного цвета, бамбуковая плантация, шоколадное дерево, конфетное дерево, мыльное дерево, жирное дерево, каштан, дуб, гортензия, китайский небесный виноград, красная мирика, Glyptostrobus pensilis, Taiwania cryptomerioides, Liquidambar formosana, Liriodendron chinense, Michelia compressa, Magnolia coco, Styrax obassia, Stewartia pseudo-camellia, Taxus mayrii, Tsuga sinensis, Alniphyllum fortunei, Illicium verum, Bischofia trifoliata, Milletia reticulata, Neolitsea sericea, Sinojackia xylocarpa, Fortunearia sinensis, Uncaria rhynchophylla, Thea sinensis, Cudrania tricuspidata, Paulownia tomentosa, Botrocarium controversum, Pterostyrax hyspida, Zelkova serrata, Larix leptolepis, Pseudolarix amabilis, Cinnamomum camphora, Chamaecyparis pizifera da obtusa, Podocarpus nagi, Castanopsis cuspidata, Buxus japonica, Lagerstroemia indica, Torreya nucifera, Sciadopitys verticillata, Trachycarpus fortunei, Pistacia chinensis, Gleditshia japonica, Melia azedarach, Euscaphys japonica, Jasminum humile, Chaenomeles japonica, Aleurites fordii, Ficus pumila, Zantoxylum schinifolium, Albizia kalkora, Trochodendron aralioides.

Согласно перечню международного союза охраны природы (IUCN), в отделе консервированы 62 вида критических видов растений, находящихся под риском исчезновения. Они насчитывают 20 семейств и 37 фамилий.

По данным на апрель 2012 года коллекция сада представлена 710 видами 257 фамилии 92 семей. В отделе расположены ландшафтные сады японского стиля.